1. Specialus meistriškumas, sunki gamyba ir aukšta kaina. Dėl ypatingų kvarcinio stiklo savybių germicidinių lempų gamyba negali būti padidinta, todėl brangios kvarcinės germicidinės lempos kainuoja ir trukdo tolesniam jos populiarinimui ir pritaikymui.
2. Šviesos skilimas yra didelis, o gyvenimo trukmė nėra ilga. Uždegus ultravioletinių spindulių baktericidinę lempą šimtus valandų, jos ultravioletinių spindulių intensyvumas greitai nyksta, pasiekdamas daugiausiai 30%, o sterilizacijos efektas labai sumažėja. Be to, katodo pažeidimas, padarytas apdorojant, taip pat turi įtakos UV germicidinės lempos tarnavimo laikui. Kadangi ultravioletinių germicidinių lempų šviesos slopinimas ir fluorescencinės šviesos slopinimas mechanizme nėra visiškai vienodi, šią problemą dar turi išspręsti visos šalys.
3. Dėl skirtingų kaitinamųjų siūlų ir katodo medžiagų UV lempos, kurių galia yra tokia pati kaip T8 ir T5 fluorescencinių lempų, negali būti valdomos tuo pačiu balastu.
